Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PABPC1P11940 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms