Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP1P09430 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP1P09430 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP1P09430 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP1P09430 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP1P09430 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP1P09430 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP1P09430 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP1P09430 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP1P09430 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP1P09430 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP1P09430 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP1P09430 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP1P09430 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP1P09430 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP1P09430 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP1P09430 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP1P09430 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP1P09430 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP1P09430 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP1P09430 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP1P09430 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP1P09430 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP1P09430 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP1P09430 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP1P09430 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP1P09430 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP1P09430 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP1P09430 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP1P09430 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP1P09430 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP1P09430 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP1P09430 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP1P09430 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP1P09430 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP1P09430 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP1P09430 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP1P09430 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP1P09430 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP1P09430 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP1P09430 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP1P09430 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP1P09430 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP1P09430 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP1P09430 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP1P09430 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TNP1P09430 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TNP1P09430 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TNP1P09430 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP1P09430 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP1P09430 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP1P09430 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP1P09430 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP1P09430 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP1P09430 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP1P09430 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP1P09430 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP1P09430 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP1P09430 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP1P09430 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP1P09430 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP1P09430 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP1P09430 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP1P09430 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP1P09430 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP1P09430 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP1P09430 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP1P09430 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP1P09430 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP1P09430 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP1P09430 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP1P09430 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP1P09430 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP1P09430 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP1P09430 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP1P09430 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP1P09430 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP1P09430 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP1P09430 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP1P09430 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP1P09430 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP1P09430 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP1P09430 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP1P09430 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP1P09430 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP1P09430 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP1P09430 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP1P09430 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP1P09430 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP1P09430 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP1P09430 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP1P09430 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP1P09430 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP1P09430 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP1P09430 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP1P09430 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP1P09430 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP1P09430 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP1P09430 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP1P09430 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms