Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSLP07711 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSLP07711 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTSLP07711 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSLP07711 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSLP07711 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSLP07711 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSLP07711 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSLP07711 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSLP07711 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSLP07711 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSLP07711 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSLP07711 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSLP07711 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSLP07711 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSLP07711 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSLP07711 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSLP07711 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSLP07711 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSLP07711 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSLP07711 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSLP07711 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSLP07711 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSLP07711 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSLP07711 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSLP07711 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSLP07711 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSLP07711 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSLP07711 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSLP07711 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSLP07711 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSLP07711 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSLP07711 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSLP07711 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSLP07711 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSLP07711 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSLP07711 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSLP07711 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSLP07711 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTSLP07711 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTSLP07711 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTSLP07711 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTSLP07711 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTSLP07711 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSLP07711 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSLP07711 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSLP07711 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSLP07711 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSLP07711 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSLP07711 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSLP07711 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSLP07711 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSLP07711 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSLP07711 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSLP07711 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSLP07711 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSLP07711 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSLP07711 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSLP07711 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSLP07711 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSLP07711 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSLP07711 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSLP07711 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSLP07711 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSLP07711 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTSLP07711 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTSLP07711 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTSLP07711 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CTSLP07711 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTSLP07711 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTSLP07711 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSLP07711 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSLP07711 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSLP07711 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSLP07711 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSLP07711 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSLP07711 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTSLP07711 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSLP07711 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSLP07711 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSLP07711 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSLP07711 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSLP07711 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSLP07711 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSLP07711 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSLP07711 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSLP07711 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSLP07711 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSLP07711 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSLP07711 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSLP07711 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSLP07711 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSLP07711 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSLP07711 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSLP07711 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSLP07711 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSLP07711 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSLP07711 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSLP07711 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSLP07711 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms