Protein–RNA interactions for Protein: P06401

PGR, Progesterone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRP06401 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGRP06401 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGRP06401 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGRP06401 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGRP06401 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGRP06401 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGRP06401 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGRP06401 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGRP06401 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGRP06401 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGRP06401 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGRP06401 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PGRP06401 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGRP06401 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGRP06401 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGRP06401 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PGRP06401 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGRP06401 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGRP06401 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGRP06401 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGRP06401 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGRP06401 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGRP06401 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGRP06401 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGRP06401 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PGRP06401 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGRP06401 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGRP06401 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGRP06401 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGRP06401 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGRP06401 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGRP06401 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGRP06401 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGRP06401 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGRP06401 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGRP06401 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGRP06401 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGRP06401 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGRP06401 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGRP06401 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGRP06401 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGRP06401 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGRP06401 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGRP06401 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGRP06401 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGRP06401 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGRP06401 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGRP06401 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGRP06401 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGRP06401 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGRP06401 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGRP06401 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGRP06401 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGRP06401 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGRP06401 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGRP06401 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGRP06401 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PGRP06401 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGRP06401 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGRP06401 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGRP06401 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGRP06401 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGRP06401 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGRP06401 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGRP06401 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGRP06401 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PGRP06401 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGRP06401 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGRP06401 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGRP06401 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGRP06401 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGRP06401 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGRP06401 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGRP06401 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGRP06401 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGRP06401 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGRP06401 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGRP06401 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGRP06401 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGRP06401 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGRP06401 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGRP06401 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGRP06401 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGRP06401 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGRP06401 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGRP06401 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGRP06401 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGRP06401 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGRP06401 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGRP06401 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGRP06401 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGRP06401 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGRP06401 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGRP06401 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PGRP06401 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGRP06401 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGRP06401 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGRP06401 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGRP06401 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGRP06401 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms