Protein–RNA interactions for Protein: P00441

SOD1, Superoxide dismutase [Cu-Zn], humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD1P00441 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOD1P00441 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOD1P00441 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOD1P00441 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOD1P00441 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SOD1P00441 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOD1P00441 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOD1P00441 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOD1P00441 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOD1P00441 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOD1P00441 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOD1P00441 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOD1P00441 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOD1P00441 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOD1P00441 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOD1P00441 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOD1P00441 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOD1P00441 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOD1P00441 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOD1P00441 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOD1P00441 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOD1P00441 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOD1P00441 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOD1P00441 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOD1P00441 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOD1P00441 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SOD1P00441 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOD1P00441 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOD1P00441 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SOD1P00441 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SOD1P00441 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SOD1P00441 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOD1P00441 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOD1P00441 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SOD1P00441 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOD1P00441 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOD1P00441 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOD1P00441 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOD1P00441 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOD1P00441 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOD1P00441 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOD1P00441 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOD1P00441 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOD1P00441 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOD1P00441 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOD1P00441 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOD1P00441 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOD1P00441 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOD1P00441 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOD1P00441 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOD1P00441 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOD1P00441 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOD1P00441 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOD1P00441 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOD1P00441 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOD1P00441 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOD1P00441 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SOD1P00441 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOD1P00441 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SOD1P00441 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOD1P00441 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOD1P00441 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOD1P00441 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOD1P00441 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOD1P00441 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOD1P00441 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOD1P00441 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOD1P00441 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOD1P00441 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOD1P00441 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOD1P00441 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOD1P00441 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOD1P00441 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOD1P00441 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOD1P00441 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOD1P00441 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOD1P00441 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOD1P00441 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOD1P00441 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOD1P00441 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOD1P00441 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOD1P00441 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOD1P00441 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOD1P00441 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOD1P00441 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOD1P00441 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOD1P00441 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOD1P00441 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOD1P00441 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOD1P00441 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOD1P00441 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOD1P00441 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOD1P00441 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOD1P00441 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOD1P00441 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SOD1P00441 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SOD1P00441 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SOD1P00441 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOD1P00441 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOD1P00441 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms