Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTLL1O95922 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL1O95922 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTLL1O95922 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms