Protein–RNA interactions for Protein: O95478

NSA2, Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSA2O95478 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NSA2O95478 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSA2O95478 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSA2O95478 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSA2O95478 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSA2O95478 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSA2O95478 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSA2O95478 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSA2O95478 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSA2O95478 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NSA2O95478 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NSA2O95478 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSA2O95478 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSA2O95478 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSA2O95478 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSA2O95478 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSA2O95478 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSA2O95478 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSA2O95478 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSA2O95478 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSA2O95478 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSA2O95478 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSA2O95478 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSA2O95478 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NSA2O95478 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSA2O95478 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSA2O95478 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSA2O95478 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSA2O95478 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NSA2O95478 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NSA2O95478 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSA2O95478 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSA2O95478 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSA2O95478 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSA2O95478 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSA2O95478 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSA2O95478 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSA2O95478 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSA2O95478 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSA2O95478 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSA2O95478 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSA2O95478 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSA2O95478 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSA2O95478 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSA2O95478 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSA2O95478 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSA2O95478 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSA2O95478 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSA2O95478 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSA2O95478 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSA2O95478 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSA2O95478 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSA2O95478 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSA2O95478 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSA2O95478 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSA2O95478 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSA2O95478 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSA2O95478 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NSA2O95478 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSA2O95478 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSA2O95478 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSA2O95478 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSA2O95478 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NSA2O95478 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSA2O95478 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSA2O95478 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSA2O95478 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSA2O95478 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSA2O95478 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSA2O95478 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSA2O95478 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSA2O95478 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSA2O95478 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSA2O95478 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSA2O95478 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSA2O95478 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSA2O95478 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSA2O95478 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSA2O95478 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSA2O95478 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSA2O95478 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NSA2O95478 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSA2O95478 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSA2O95478 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSA2O95478 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSA2O95478 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSA2O95478 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSA2O95478 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSA2O95478 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSA2O95478 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSA2O95478 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSA2O95478 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSA2O95478 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSA2O95478 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSA2O95478 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSA2O95478 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSA2O95478 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSA2O95478 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSA2O95478 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSA2O95478 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms