Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM4AO75164 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM4AO75164 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM4AO75164 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM4AO75164 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM4AO75164 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM4AO75164 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM4AO75164 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM4AO75164 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM4AO75164 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM4AO75164 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM4AO75164 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM4AO75164 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM4AO75164 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM4AO75164 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM4AO75164 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM4AO75164 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM4AO75164 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM4AO75164 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM4AO75164 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM4AO75164 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM4AO75164 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM4AO75164 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM4AO75164 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM4AO75164 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM4AO75164 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM4AO75164 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM4AO75164 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms