Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEMFO60524 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEMFO60524 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEMFO60524 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NEMFO60524 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEMFO60524 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEMFO60524 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEMFO60524 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEMFO60524 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEMFO60524 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEMFO60524 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NEMFO60524 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEMFO60524 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEMFO60524 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEMFO60524 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEMFO60524 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEMFO60524 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEMFO60524 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEMFO60524 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEMFO60524 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEMFO60524 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEMFO60524 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEMFO60524 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEMFO60524 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEMFO60524 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEMFO60524 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEMFO60524 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEMFO60524 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEMFO60524 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEMFO60524 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEMFO60524 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEMFO60524 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEMFO60524 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEMFO60524 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEMFO60524 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEMFO60524 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEMFO60524 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEMFO60524 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEMFO60524 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEMFO60524 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEMFO60524 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEMFO60524 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEMFO60524 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NEMFO60524 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEMFO60524 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEMFO60524 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEMFO60524 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEMFO60524 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEMFO60524 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEMFO60524 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEMFO60524 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NEMFO60524 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEMFO60524 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEMFO60524 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NEMFO60524 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NEMFO60524 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NEMFO60524 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEMFO60524 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEMFO60524 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEMFO60524 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEMFO60524 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEMFO60524 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEMFO60524 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEMFO60524 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEMFO60524 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEMFO60524 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEMFO60524 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEMFO60524 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEMFO60524 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEMFO60524 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEMFO60524 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NEMFO60524 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEMFO60524 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEMFO60524 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEMFO60524 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEMFO60524 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEMFO60524 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEMFO60524 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NEMFO60524 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEMFO60524 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEMFO60524 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEMFO60524 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEMFO60524 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEMFO60524 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEMFO60524 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NEMFO60524 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEMFO60524 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEMFO60524 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEMFO60524 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NEMFO60524 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEMFO60524 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEMFO60524 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEMFO60524 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEMFO60524 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEMFO60524 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NEMFO60524 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEMFO60524 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEMFO60524 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEMFO60524 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEMFO60524 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms