Protein–RNA interactions for Protein: O60229

KALRN, Kalirin, humanhuman

Predictions only

Length 2,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KALRNO60229 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KALRNO60229 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KALRNO60229 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KALRNO60229 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KALRNO60229 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KALRNO60229 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KALRNO60229 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KALRNO60229 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KALRNO60229 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KALRNO60229 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KALRNO60229 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KALRNO60229 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KALRNO60229 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KALRNO60229 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KALRNO60229 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KALRNO60229 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KALRNO60229 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KALRNO60229 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KALRNO60229 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KALRNO60229 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KALRNO60229 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KALRNO60229 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KALRNO60229 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KALRNO60229 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KALRNO60229 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KALRNO60229 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KALRNO60229 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KALRNO60229 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KALRNO60229 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KALRNO60229 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KALRNO60229 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KALRNO60229 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KALRNO60229 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KALRNO60229 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KALRNO60229 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KALRNO60229 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KALRNO60229 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KALRNO60229 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KALRNO60229 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KALRNO60229 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KALRNO60229 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KALRNO60229 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KALRNO60229 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KALRNO60229 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KALRNO60229 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KALRNO60229 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KALRNO60229 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KALRNO60229 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KALRNO60229 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KALRNO60229 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KALRNO60229 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KALRNO60229 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KALRNO60229 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KALRNO60229 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KALRNO60229 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KALRNO60229 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KALRNO60229 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KALRNO60229 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KALRNO60229 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KALRNO60229 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KALRNO60229 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KALRNO60229 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KALRNO60229 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KALRNO60229 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KALRNO60229 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KALRNO60229 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KALRNO60229 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KALRNO60229 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KALRNO60229 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KALRNO60229 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KALRNO60229 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KALRNO60229 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KALRNO60229 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KALRNO60229 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KALRNO60229 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KALRNO60229 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KALRNO60229 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KALRNO60229 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KALRNO60229 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KALRNO60229 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KALRNO60229 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KALRNO60229 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KALRNO60229 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KALRNO60229 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KALRNO60229 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KALRNO60229 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KALRNO60229 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KALRNO60229 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KALRNO60229 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KALRNO60229 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KALRNO60229 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KALRNO60229 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KALRNO60229 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KALRNO60229 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KALRNO60229 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KALRNO60229 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KALRNO60229 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KALRNO60229 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KALRNO60229 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KALRNO60229 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms