Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCO2O43819 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCO2O43819 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCO2O43819 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCO2O43819 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCO2O43819 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCO2O43819 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCO2O43819 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCO2O43819 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCO2O43819 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCO2O43819 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCO2O43819 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCO2O43819 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCO2O43819 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCO2O43819 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCO2O43819 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCO2O43819 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCO2O43819 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCO2O43819 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCO2O43819 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCO2O43819 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCO2O43819 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCO2O43819 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCO2O43819 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCO2O43819 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCO2O43819 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCO2O43819 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCO2O43819 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCO2O43819 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCO2O43819 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCO2O43819 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCO2O43819 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCO2O43819 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCO2O43819 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCO2O43819 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCO2O43819 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCO2O43819 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCO2O43819 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCO2O43819 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCO2O43819 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCO2O43819 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCO2O43819 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCO2O43819 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCO2O43819 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCO2O43819 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCO2O43819 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCO2O43819 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCO2O43819 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCO2O43819 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCO2O43819 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCO2O43819 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCO2O43819 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCO2O43819 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCO2O43819 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCO2O43819 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCO2O43819 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCO2O43819 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCO2O43819 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCO2O43819 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCO2O43819 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCO2O43819 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCO2O43819 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCO2O43819 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCO2O43819 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCO2O43819 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCO2O43819 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCO2O43819 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCO2O43819 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCO2O43819 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCO2O43819 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCO2O43819 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCO2O43819 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCO2O43819 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCO2O43819 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCO2O43819 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCO2O43819 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCO2O43819 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCO2O43819 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCO2O43819 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCO2O43819 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCO2O43819 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCO2O43819 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCO2O43819 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCO2O43819 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCO2O43819 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCO2O43819 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCO2O43819 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCO2O43819 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCO2O43819 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCO2O43819 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCO2O43819 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCO2O43819 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCO2O43819 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCO2O43819 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCO2O43819 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCO2O43819 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCO2O43819 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCO2O43819 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCO2O43819 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCO2O43819 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms