Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KDELR3O43731 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDELR3O43731 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms