Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1GO43497 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms