Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLGNO14967 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLGNO14967 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLGNO14967 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLGNO14967 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLGNO14967 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLGNO14967 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLGNO14967 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLGNO14967 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLGNO14967 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLGNO14967 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLGNO14967 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLGNO14967 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLGNO14967 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLGNO14967 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLGNO14967 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLGNO14967 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLGNO14967 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLGNO14967 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLGNO14967 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLGNO14967 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLGNO14967 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLGNO14967 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLGNO14967 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLGNO14967 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLGNO14967 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLGNO14967 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLGNO14967 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLGNO14967 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLGNO14967 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLGNO14967 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLGNO14967 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLGNO14967 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLGNO14967 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLGNO14967 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLGNO14967 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLGNO14967 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CLGNO14967 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLGNO14967 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLGNO14967 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLGNO14967 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLGNO14967 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLGNO14967 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLGNO14967 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLGNO14967 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLGNO14967 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLGNO14967 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLGNO14967 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLGNO14967 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CLGNO14967 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLGNO14967 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLGNO14967 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLGNO14967 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLGNO14967 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLGNO14967 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLGNO14967 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLGNO14967 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLGNO14967 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLGNO14967 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLGNO14967 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLGNO14967 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLGNO14967 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLGNO14967 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLGNO14967 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLGNO14967 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLGNO14967 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLGNO14967 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLGNO14967 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CLGNO14967 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLGNO14967 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLGNO14967 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLGNO14967 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLGNO14967 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLGNO14967 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLGNO14967 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLGNO14967 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLGNO14967 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLGNO14967 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLGNO14967 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLGNO14967 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLGNO14967 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLGNO14967 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLGNO14967 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLGNO14967 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLGNO14967 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLGNO14967 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLGNO14967 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLGNO14967 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLGNO14967 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLGNO14967 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLGNO14967 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLGNO14967 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLGNO14967 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLGNO14967 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLGNO14967 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLGNO14967 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CLGNO14967 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLGNO14967 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLGNO14967 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLGNO14967 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms