Protein–RNA interactions for Protein: O00567

NOP56, Nucleolar protein 56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56O00567 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOP56O00567 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP56O00567 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP56O00567 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP56O00567 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP56O00567 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP56O00567 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP56O00567 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP56O00567 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP56O00567 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP56O00567 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP56O00567 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOP56O00567 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOP56O00567 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NOP56O00567 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NOP56O00567 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOP56O00567 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOP56O00567 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOP56O00567 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NOP56O00567 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOP56O00567 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NOP56O00567 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOP56O00567 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOP56O00567 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOP56O00567 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOP56O00567 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NOP56O00567 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NOP56O00567 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NOP56O00567 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NOP56O00567 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NOP56O00567 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP56O00567 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP56O00567 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP56O00567 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP56O00567 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP56O00567 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP56O00567 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOP56O00567 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOP56O00567 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOP56O00567 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOP56O00567 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOP56O00567 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOP56O00567 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOP56O00567 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOP56O00567 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOP56O00567 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOP56O00567 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOP56O00567 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOP56O00567 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOP56O00567 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOP56O00567 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOP56O00567 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOP56O00567 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOP56O00567 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOP56O00567 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOP56O00567 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOP56O00567 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOP56O00567 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOP56O00567 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOP56O00567 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOP56O00567 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOP56O00567 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NOP56O00567 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOP56O00567 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOP56O00567 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOP56O00567 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOP56O00567 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOP56O00567 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOP56O00567 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NOP56O00567 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NOP56O00567 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOP56O00567 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOP56O00567 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOP56O00567 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOP56O00567 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOP56O00567 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOP56O00567 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOP56O00567 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOP56O00567 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOP56O00567 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOP56O00567 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NOP56O00567 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOP56O00567 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NOP56O00567 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NOP56O00567 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOP56O00567 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NOP56O00567 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NOP56O00567 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOP56O00567 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOP56O00567 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOP56O00567 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOP56O00567 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NOP56O00567 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOP56O00567 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOP56O00567 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOP56O00567 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOP56O00567 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOP56O00567 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOP56O00567 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOP56O00567 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms