Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TULP1O00294 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TULP1O00294 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TULP1O00294 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TULP1O00294 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TULP1O00294 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TULP1O00294 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TULP1O00294 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TULP1O00294 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TULP1O00294 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TULP1O00294 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TULP1O00294 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TULP1O00294 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TULP1O00294 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TULP1O00294 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TULP1O00294 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TULP1O00294 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TULP1O00294 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TULP1O00294 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TULP1O00294 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TULP1O00294 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TULP1O00294 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TULP1O00294 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TULP1O00294 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TULP1O00294 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TULP1O00294 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TULP1O00294 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TULP1O00294 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TULP1O00294 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TULP1O00294 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TULP1O00294 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TULP1O00294 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TULP1O00294 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TULP1O00294 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TULP1O00294 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TULP1O00294 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TULP1O00294 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TULP1O00294 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TULP1O00294 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TULP1O00294 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TULP1O00294 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TULP1O00294 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TULP1O00294 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TULP1O00294 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TULP1O00294 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TULP1O00294 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TULP1O00294 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TULP1O00294 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TULP1O00294 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TULP1O00294 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TULP1O00294 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TULP1O00294 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TULP1O00294 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP1O00294 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP1O00294 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP1O00294 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TULP1O00294 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TULP1O00294 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TULP1O00294 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TULP1O00294 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TULP1O00294 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TULP1O00294 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TULP1O00294 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TULP1O00294 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TULP1O00294 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TULP1O00294 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TULP1O00294 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TULP1O00294 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TULP1O00294 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TULP1O00294 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TULP1O00294 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TULP1O00294 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TULP1O00294 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TULP1O00294 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TULP1O00294 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP1O00294 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP1O00294 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP1O00294 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP1O00294 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP1O00294 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP1O00294 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP1O00294 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP1O00294 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP1O00294 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP1O00294 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP1O00294 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP1O00294 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP1O00294 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP1O00294 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP1O00294 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP1O00294 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP1O00294 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP1O00294 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP1O00294 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP1O00294 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP1O00294 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP1O00294 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP1O00294 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP1O00294 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP1O00294 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms