Protein–RNA interactions for Protein: J3QRE1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRE1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QRE1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QRE1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QRE1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QRE1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QRE1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QRE1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QRE1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QRE1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QRE1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QRE1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QRE1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3QRE1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3QRE1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3QRE1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3QRE1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3QRE1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3QRE1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3QRE1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3QRE1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3QRE1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3QRE1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3QRE1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3QRE1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3QRE1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QRE1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QRE1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QRE1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QRE1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QRE1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QRE1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QRE1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QRE1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QRE1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QRE1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QRE1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QRE1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QRE1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QRE1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
J3QRE1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
J3QRE1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
J3QRE1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
J3QRE1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
J3QRE1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QRE1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QRE1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QRE1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QRE1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QRE1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QRE1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QRE1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QRE1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QRE1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QRE1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QRE1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QRE1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QRE1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QRE1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QRE1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QRE1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QRE1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QRE1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3QRE1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QRE1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QRE1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QRE1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QRE1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QRE1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QRE1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QRE1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QRE1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QRE1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QRE1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QRE1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QRE1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QRE1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QRE1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QRE1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QRE1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QRE1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QRE1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QRE1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QRE1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QRE1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QRE1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QRE1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QRE1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QRE1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QRE1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QRE1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QRE1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QRE1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QRE1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QRE1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QRE1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QRE1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QRE1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QRE1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QRE1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3QRE1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.8 ms