Protein–RNA interactions for Protein: H3BMM5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMM5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BMM5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BMM5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BMM5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BMM5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BMM5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BMM5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BMM5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BMM5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BMM5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BMM5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BMM5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BMM5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BMM5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BMM5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BMM5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3BMM5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BMM5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BMM5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BMM5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3BMM5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24■■□□□ 1.43
H3BMM5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BMM5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3BMM5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3BMM5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3BMM5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BMM5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BMM5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BMM5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BMM5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BMM5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BMM5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BMM5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BMM5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BMM5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BMM5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BMM5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BMM5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BMM5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BMM5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BMM5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BMM5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BMM5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BMM5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BMM5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BMM5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BMM5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BMM5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BMM5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BMM5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BMM5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BMM5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BMM5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BMM5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
H3BMM5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BMM5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BMM5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BMM5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BMM5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BMM5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BMM5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BMM5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BMM5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BMM5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BMM5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BMM5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3BMM5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3BMM5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3BMM5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3BMM5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H3BMM5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H3BMM5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BMM5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BMM5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BMM5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BMM5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BMM5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H3BMM5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H3BMM5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H3BMM5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
H3BMM5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
H3BMM5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
H3BMM5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
H3BMM5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
H3BMM5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
H3BMM5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
H3BMM5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BMM5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BMM5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BMM5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BMM5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BMM5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BMM5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BMM5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BMM5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BMM5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BMM5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BMM5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BMM5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BMM5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms