Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPB9F8W1W9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPB9F8W1W9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPIPB9F8W1W9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPB9F8W1W9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPB9F8W1W9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPB9F8W1W9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPB9F8W1W9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPB9F8W1W9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPB9F8W1W9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPB9F8W1W9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPB9F8W1W9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPB9F8W1W9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPB9F8W1W9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPB9F8W1W9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPB9F8W1W9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPB9F8W1W9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPB9F8W1W9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPB9F8W1W9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPB9F8W1W9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPB9F8W1W9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPB9F8W1W9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPB9F8W1W9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPB9F8W1W9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPB9F8W1W9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPB9F8W1W9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPB9F8W1W9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPB9F8W1W9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPB9F8W1W9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms