Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBD1B2RD01 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms