Protein–RNA interactions for Protein: A9Z1Z3

FER1L4, Fer-1-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FER1L4A9Z1Z3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC36.31■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
FER1L4A9Z1Z3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
FER1L4A9Z1Z3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
FER1L4A9Z1Z3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
FER1L4A9Z1Z3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
FER1L4A9Z1Z3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
FER1L4A9Z1Z3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
FER1L4A9Z1Z3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
FER1L4A9Z1Z3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
FER1L4A9Z1Z3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
FER1L4A9Z1Z3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
FER1L4A9Z1Z3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
FER1L4A9Z1Z3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
FER1L4A9Z1Z3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
FER1L4A9Z1Z3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
FER1L4A9Z1Z3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
FER1L4A9Z1Z3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
FER1L4A9Z1Z3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
FER1L4A9Z1Z3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
FER1L4A9Z1Z3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
FER1L4A9Z1Z3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
FER1L4A9Z1Z3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
FER1L4A9Z1Z3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
FER1L4A9Z1Z3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
FER1L4A9Z1Z3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.38
FER1L4A9Z1Z3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC36.2■■■■□ 3.38
FER1L4A9Z1Z3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC36.2■■■■□ 3.38
FER1L4A9Z1Z3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC36.2■■■■□ 3.38
FER1L4A9Z1Z3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
FER1L4A9Z1Z3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC36.2■■■■□ 3.38
FER1L4A9Z1Z3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
FER1L4A9Z1Z3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
FER1L4A9Z1Z3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
FER1L4A9Z1Z3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
FER1L4A9Z1Z3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
FER1L4A9Z1Z3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
FER1L4A9Z1Z3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
FER1L4A9Z1Z3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
FER1L4A9Z1Z3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
FER1L4A9Z1Z3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
FER1L4A9Z1Z3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
FER1L4A9Z1Z3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
FER1L4A9Z1Z3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
FER1L4A9Z1Z3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
FER1L4A9Z1Z3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
FER1L4A9Z1Z3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
FER1L4A9Z1Z3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
FER1L4A9Z1Z3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
FER1L4A9Z1Z3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
FER1L4A9Z1Z3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
FER1L4A9Z1Z3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
FER1L4A9Z1Z3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
FER1L4A9Z1Z3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
FER1L4A9Z1Z3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
FER1L4A9Z1Z3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
FER1L4A9Z1Z3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
FER1L4A9Z1Z3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
FER1L4A9Z1Z3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
FER1L4A9Z1Z3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
FER1L4A9Z1Z3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
FER1L4A9Z1Z3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
FER1L4A9Z1Z3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
FER1L4A9Z1Z3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
FER1L4A9Z1Z3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
FER1L4A9Z1Z3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
FER1L4A9Z1Z3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
FER1L4A9Z1Z3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
FER1L4A9Z1Z3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.37
FER1L4A9Z1Z3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
FER1L4A9Z1Z3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
FER1L4A9Z1Z3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
FER1L4A9Z1Z3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
FER1L4A9Z1Z3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.2 ms