Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4orf47A7E2U8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms