Protein–RNA interactions for Protein: A6NM43

CCT8L1P, Putative T-complex protein 1 subunit theta-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L1PA6NM43 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCT8L1PA6NM43 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCT8L1PA6NM43 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms