Protein–RNA interactions for Protein: A6NIZ1

Ras-related protein Rap-1b-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NIZ1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A6NIZ1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
A6NIZ1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A6NIZ1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A6NIZ1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A6NIZ1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A6NIZ1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A6NIZ1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A6NIZ1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A6NIZ1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A6NIZ1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A6NIZ1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A6NIZ1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A6NIZ1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A6NIZ1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A6NIZ1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A6NIZ1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
A6NIZ1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A6NIZ1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A6NIZ1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A6NIZ1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A6NIZ1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A6NIZ1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A6NIZ1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A6NIZ1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A6NIZ1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A6NIZ1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
A6NIZ1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A6NIZ1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A6NIZ1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A6NIZ1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
A6NIZ1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A6NIZ1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A6NIZ1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A6NIZ1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
A6NIZ1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A6NIZ1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
A6NIZ1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A6NIZ1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A6NIZ1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A6NIZ1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A6NIZ1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A6NIZ1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A6NIZ1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A6NIZ1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A6NIZ1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A6NIZ1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A6NIZ1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A6NIZ1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A6NIZ1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A6NIZ1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A6NIZ1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A6NIZ1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A6NIZ1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A6NIZ1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A6NIZ1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
A6NIZ1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A6NIZ1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A6NIZ1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A6NIZ1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A6NIZ1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A6NIZ1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A6NIZ1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
A6NIZ1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A6NIZ1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A6NIZ1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
A6NIZ1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A6NIZ1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A6NIZ1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A6NIZ1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
A6NIZ1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A6NIZ1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A6NIZ1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A6NIZ1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NIZ1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NIZ1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NIZ1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NIZ1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NIZ1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NIZ1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NIZ1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NIZ1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NIZ1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
A6NIZ1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NIZ1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NIZ1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NIZ1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NIZ1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NIZ1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NIZ1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NIZ1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NIZ1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NIZ1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NIZ1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NIZ1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NIZ1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NIZ1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NIZ1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NIZ1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NIZ1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms