Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN8

Uncharacterized protein ENSP00000372125, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NCN8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NCN8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NCN8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NCN8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NCN8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NCN8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NCN8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NCN8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
A6NCN8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A6NCN8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A6NCN8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A6NCN8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A6NCN8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A6NCN8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NCN8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NCN8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NCN8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NCN8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NCN8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NCN8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NCN8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NCN8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NCN8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NCN8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NCN8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NCN8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NCN8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NCN8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NCN8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NCN8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NCN8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NCN8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A6NCN8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A6NCN8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A6NCN8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
A6NCN8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A6NCN8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A6NCN8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A6NCN8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A6NCN8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
A6NCN8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
A6NCN8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NCN8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NCN8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NCN8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NCN8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NCN8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NCN8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NCN8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NCN8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NCN8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NCN8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NCN8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NCN8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NCN8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NCN8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NCN8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A6NCN8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A6NCN8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A6NCN8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A6NCN8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A6NCN8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A6NCN8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A6NCN8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A6NCN8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
A6NCN8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A6NCN8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NCN8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NCN8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NCN8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NCN8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NCN8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NCN8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NCN8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NCN8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NCN8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NCN8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NCN8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NCN8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NCN8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NCN8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NCN8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NCN8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NCN8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NCN8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NCN8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NCN8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NCN8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NCN8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NCN8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NCN8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NCN8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NCN8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NCN8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NCN8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NCN8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NCN8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NCN8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NCN8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NCN8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms