Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GTF3C3Q9Y5Q9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GTF3C3Q9Y5Q9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GTF3C3Q9Y5Q9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GTF3C3Q9Y5Q9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GTF3C3Q9Y5Q9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GTF3C3Q9Y5Q9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GTF3C3Q9Y5Q9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GTF3C3Q9Y5Q9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GTF3C3Q9Y5Q9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GTF3C3Q9Y5Q9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GTF3C3Q9Y5Q9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GTF3C3Q9Y5Q9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GTF3C3Q9Y5Q9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GTF3C3Q9Y5Q9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GTF3C3Q9Y5Q9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GTF3C3Q9Y5Q9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GTF3C3Q9Y5Q9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GTF3C3Q9Y5Q9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GTF3C3Q9Y5Q9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GTF3C3Q9Y5Q9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GTF3C3Q9Y5Q9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GTF3C3Q9Y5Q9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GTF3C3Q9Y5Q9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GTF3C3Q9Y5Q9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
GTF3C3Q9Y5Q9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GTF3C3Q9Y5Q9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GTF3C3Q9Y5Q9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GTF3C3Q9Y5Q9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GTF3C3Q9Y5Q9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GTF3C3Q9Y5Q9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GTF3C3Q9Y5Q9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GTF3C3Q9Y5Q9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GTF3C3Q9Y5Q9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
GTF3C3Q9Y5Q9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
GTF3C3Q9Y5Q9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GTF3C3Q9Y5Q9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GTF3C3Q9Y5Q9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GTF3C3Q9Y5Q9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GTF3C3Q9Y5Q9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GTF3C3Q9Y5Q9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GTF3C3Q9Y5Q9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GTF3C3Q9Y5Q9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GTF3C3Q9Y5Q9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GTF3C3Q9Y5Q9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GTF3C3Q9Y5Q9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GTF3C3Q9Y5Q9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GTF3C3Q9Y5Q9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GTF3C3Q9Y5Q9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GTF3C3Q9Y5Q9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GTF3C3Q9Y5Q9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GTF3C3Q9Y5Q9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GTF3C3Q9Y5Q9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms