Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL4A3BPQ9Y5P4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL4A3BPQ9Y5P4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL4A3BPQ9Y5P4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL4A3BPQ9Y5P4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL4A3BPQ9Y5P4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL4A3BPQ9Y5P4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL4A3BPQ9Y5P4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
COL4A3BPQ9Y5P4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
COL4A3BPQ9Y5P4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL4A3BPQ9Y5P4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms