Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP12Q9Y561 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms