Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOD1Q9Y239 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOD1Q9Y239 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms