Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
HPS5Q9UPZ3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HPS5Q9UPZ3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HPS5Q9UPZ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms