Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK5

VANGL2, Vang-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VANGL2Q9ULK5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VANGL2Q9ULK5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VANGL2Q9ULK5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VANGL2Q9ULK5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VANGL2Q9ULK5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VANGL2Q9ULK5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VANGL2Q9ULK5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VANGL2Q9ULK5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VANGL2Q9ULK5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VANGL2Q9ULK5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VANGL2Q9ULK5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VANGL2Q9ULK5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VANGL2Q9ULK5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VANGL2Q9ULK5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VANGL2Q9ULK5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VANGL2Q9ULK5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VANGL2Q9ULK5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VANGL2Q9ULK5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VANGL2Q9ULK5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VANGL2Q9ULK5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VANGL2Q9ULK5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms