Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD3Q9UJU5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms