Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV9

PFDN2, Prefoldin subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN2Q9UHV9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PFDN2Q9UHV9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms