Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBG3

CRNN, Cornulin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNNQ9UBG3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRNNQ9UBG3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRNNQ9UBG3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRNNQ9UBG3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRNNQ9UBG3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRNNQ9UBG3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRNNQ9UBG3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRNNQ9UBG3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRNNQ9UBG3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRNNQ9UBG3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRNNQ9UBG3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRNNQ9UBG3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRNNQ9UBG3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRNNQ9UBG3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNNQ9UBG3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNNQ9UBG3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNNQ9UBG3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNNQ9UBG3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNNQ9UBG3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNNQ9UBG3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRNNQ9UBG3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRNNQ9UBG3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRNNQ9UBG3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRNNQ9UBG3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRNNQ9UBG3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRNNQ9UBG3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms