Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms