Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRP1BQ9NZR2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 314.3 ms