Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNK4Q9NYG8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNK4Q9NYG8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms