Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TMEM140Q9NV12 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TMEM140Q9NV12 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TMEM140Q9NV12 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TMEM140Q9NV12 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM140Q9NV12 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM140Q9NV12 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms