Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTPS2Q9NRF8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms