Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FSCN3Q9NQT6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSCN3Q9NQT6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms