Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG8

CWC22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC22Q9HCG8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CWC22Q9HCG8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CWC22Q9HCG8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CWC22Q9HCG8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CWC22Q9HCG8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CWC22Q9HCG8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CWC22Q9HCG8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CWC22Q9HCG8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CWC22Q9HCG8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CWC22Q9HCG8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CWC22Q9HCG8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CWC22Q9HCG8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CWC22Q9HCG8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CWC22Q9HCG8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CWC22Q9HCG8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CWC22Q9HCG8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CWC22Q9HCG8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CWC22Q9HCG8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CWC22Q9HCG8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CWC22Q9HCG8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CWC22Q9HCG8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CWC22Q9HCG8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CWC22Q9HCG8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CWC22Q9HCG8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CWC22Q9HCG8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CWC22Q9HCG8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CWC22Q9HCG8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CWC22Q9HCG8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CWC22Q9HCG8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CWC22Q9HCG8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CWC22Q9HCG8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CWC22Q9HCG8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CWC22Q9HCG8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CWC22Q9HCG8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CWC22Q9HCG8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CWC22Q9HCG8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CWC22Q9HCG8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CWC22Q9HCG8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CWC22Q9HCG8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CWC22Q9HCG8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CWC22Q9HCG8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CWC22Q9HCG8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CWC22Q9HCG8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CWC22Q9HCG8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CWC22Q9HCG8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CWC22Q9HCG8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CWC22Q9HCG8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CWC22Q9HCG8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CWC22Q9HCG8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CWC22Q9HCG8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CWC22Q9HCG8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CWC22Q9HCG8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CWC22Q9HCG8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CWC22Q9HCG8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CWC22Q9HCG8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CWC22Q9HCG8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CWC22Q9HCG8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CWC22Q9HCG8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CWC22Q9HCG8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CWC22Q9HCG8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CWC22Q9HCG8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CWC22Q9HCG8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CWC22Q9HCG8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CWC22Q9HCG8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CWC22Q9HCG8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CWC22Q9HCG8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms