Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CBX8Q9HC52 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBX8Q9HC52 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms