Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBEC3GQ9HC16 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBEC3GQ9HC16 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBEC3GQ9HC16 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBEC3GQ9HC16 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBEC3GQ9HC16 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBEC3GQ9HC16 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBEC3GQ9HC16 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBEC3GQ9HC16 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBEC3GQ9HC16 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBEC3GQ9HC16 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBEC3GQ9HC16 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBEC3GQ9HC16 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBEC3GQ9HC16 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBEC3GQ9HC16 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBEC3GQ9HC16 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBEC3GQ9HC16 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
APOBEC3GQ9HC16 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
APOBEC3GQ9HC16 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBEC3GQ9HC16 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
APOBEC3GQ9HC16 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC3GQ9HC16 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC3GQ9HC16 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC3GQ9HC16 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC3GQ9HC16 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC3GQ9HC16 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC3GQ9HC16 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC3GQ9HC16 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC3GQ9HC16 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBEC3GQ9HC16 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBEC3GQ9HC16 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBEC3GQ9HC16 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBEC3GQ9HC16 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC3GQ9HC16 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC3GQ9HC16 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC3GQ9HC16 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC3GQ9HC16 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3GQ9HC16 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3GQ9HC16 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3GQ9HC16 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms