Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CLMPQ9H6B4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLMPQ9H6B4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLMPQ9H6B4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLMPQ9H6B4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLMPQ9H6B4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLMPQ9H6B4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLMPQ9H6B4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms