Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM8

NDEL1, Nuclear distribution protein nudE-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDEL1Q9GZM8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDEL1Q9GZM8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms