Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHACTR1Q9C0D0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms