Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC2Q9BYS8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRC2Q9BYS8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC2Q9BYS8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC2Q9BYS8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC2Q9BYS8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC2Q9BYS8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC2Q9BYS8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC2Q9BYS8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC2Q9BYS8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC2Q9BYS8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC2Q9BYS8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC2Q9BYS8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC2Q9BYS8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC2Q9BYS8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC2Q9BYS8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC2Q9BYS8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC2Q9BYS8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC2Q9BYS8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC2Q9BYS8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC2Q9BYS8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC2Q9BYS8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC2Q9BYS8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC2Q9BYS8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC2Q9BYS8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC2Q9BYS8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC2Q9BYS8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC2Q9BYS8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC2Q9BYS8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRC2Q9BYS8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC2Q9BYS8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC2Q9BYS8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC2Q9BYS8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC2Q9BYS8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC2Q9BYS8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC2Q9BYS8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC2Q9BYS8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC2Q9BYS8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC2Q9BYS8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms