Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
YTHDF1Q9BYJ9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF1Q9BYJ9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms