Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AGMATQ9BSE5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
AGMATQ9BSE5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
AGMATQ9BSE5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AGMATQ9BSE5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AGMATQ9BSE5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AGMATQ9BSE5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AGMATQ9BSE5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AGMATQ9BSE5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AGMATQ9BSE5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AGMATQ9BSE5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AGMATQ9BSE5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AGMATQ9BSE5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AGMATQ9BSE5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AGMATQ9BSE5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
AGMATQ9BSE5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
AGMATQ9BSE5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AGMATQ9BSE5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AGMATQ9BSE5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms