Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USB1Q9BQ65 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USB1Q9BQ65 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms